Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SpibO35906 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SpibO35906 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SpibO35906 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SpibO35906 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SpibO35906 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SpibO35906 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SpibO35906 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SpibO35906 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SpibO35906 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpibO35906 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpibO35906 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpibO35906 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpibO35906 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpibO35906 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpibO35906 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpibO35906 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpibO35906 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpibO35906 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SpibO35906 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SpibO35906 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SpibO35906 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SpibO35906 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpibO35906 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpibO35906 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpibO35906 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpibO35906 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SpibO35906 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpibO35906 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpibO35906 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpibO35906 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpibO35906 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpibO35906 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpibO35906 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpibO35906 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpibO35906 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SpibO35906 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SpibO35906 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SpibO35906 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SpibO35906 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SpibO35906 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SpibO35906 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SpibO35906 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SpibO35906 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SpibO35906 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SpibO35906 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SpibO35906 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SpibO35906 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SpibO35906 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SpibO35906 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SpibO35906 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SpibO35906 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SpibO35906 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SpibO35906 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SpibO35906 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SpibO35906 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SpibO35906 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SpibO35906 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SpibO35906 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SpibO35906 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SpibO35906 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SpibO35906 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpibO35906 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpibO35906 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpibO35906 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpibO35906 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpibO35906 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpibO35906 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpibO35906 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SpibO35906 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpibO35906 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpibO35906 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpibO35906 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpibO35906 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpibO35906 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpibO35906 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpibO35906 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpibO35906 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpibO35906 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpibO35906 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpibO35906 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpibO35906 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpibO35906 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpibO35906 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpibO35906 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpibO35906 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpibO35906 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpibO35906 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpibO35906 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SpibO35906 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SpibO35906 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SpibO35906 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SpibO35906 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SpibO35906 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SpibO35906 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SpibO35906 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SpibO35906 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SpibO35906 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SpibO35906 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SpibO35906 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms