Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk4O35493 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk4O35493 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk4O35493 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk4O35493 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk4O35493 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk4O35493 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk4O35493 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk4O35493 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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