Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn1O35350 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn1O35350 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn1O35350 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn1O35350 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn1O35350 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn1O35350 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn1O35350 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms