Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kpna3O35344 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kpna3O35344 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna3O35344 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms