Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh2d1bO35324 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms