Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfil3O08750 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfil3O08750 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms