Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp12O08736 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp12O08736 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp12O08736 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp12O08736 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp12O08736 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp12O08736 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp12O08736 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casp12O08736 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casp12O08736 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp12O08736 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp12O08736 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp12O08736 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp12O08736 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp12O08736 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp12O08736 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp12O08736 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms