Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MttpO08601 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MttpO08601 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MttpO08601 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MttpO08601 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MttpO08601 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MttpO08601 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MttpO08601 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MttpO08601 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MttpO08601 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MttpO08601 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MttpO08601 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MttpO08601 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MttpO08601 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MttpO08601 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MttpO08601 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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MttpO08601 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MttpO08601 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MttpO08601 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MttpO08601 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
MttpO08601 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MttpO08601 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MttpO08601 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MttpO08601 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MttpO08601 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MttpO08601 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MttpO08601 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MttpO08601 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MttpO08601 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MttpO08601 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MttpO08601 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MttpO08601 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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MttpO08601 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MttpO08601 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MttpO08601 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MttpO08601 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MttpO08601 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MttpO08601 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MttpO08601 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MttpO08601 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MttpO08601 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MttpO08601 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MttpO08601 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MttpO08601 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MttpO08601 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MttpO08601 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MttpO08601 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MttpO08601 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MttpO08601 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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MttpO08601 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MttpO08601 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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MttpO08601 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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MttpO08601 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MttpO08601 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MttpO08601 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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MttpO08601 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MttpO08601 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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MttpO08601 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MttpO08601 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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MttpO08601 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MttpO08601 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MttpO08601 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MttpO08601 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MttpO08601 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MttpO08601 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MttpO08601 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
MttpO08601 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
MttpO08601 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MttpO08601 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MttpO08601 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MttpO08601 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MttpO08601 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MttpO08601 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MttpO08601 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MttpO08601 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MttpO08601 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MttpO08601 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MttpO08601 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms