Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a18J3QN01 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms