Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20834J3QM72 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20834J3QM72 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms