Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm29394H3BIW7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms