Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Farp1F8VPU2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Farp1F8VPU2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms