Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pagr1bF6V0H0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms