Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933403O08RikF6UK53 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933403O08RikF6UK53 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms