Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930451I11RikE9Q9R3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930451I11RikE9Q9R3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms