Protein–RNA interactions for Protein: E9Q735

Ube4a, Ubiquitin conjugation factor E4 A, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube4aE9Q735 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube4aE9Q735 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube4aE9Q735 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube4aE9Q735 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube4aE9Q735 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ube4aE9Q735 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ube4aE9Q735 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ube4aE9Q735 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ube4aE9Q735 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube4aE9Q735 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms