Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC030500E9Q6W0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC030500E9Q6W0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms