Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Simc1E9Q6E9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Simc1E9Q6E9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms