Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FancfE9Q5Z5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms