Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5F9

Setd2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, mousemouse

Predictions only

Length 2,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd2E9Q5F9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd2E9Q5F9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Setd2E9Q5F9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms