Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20518E9Q548 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms