Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nup153E9Q3G8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup153E9Q3G8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms