Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5430401F13RikE9Q328 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430401F13RikE9Q328 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms