Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcc4E9Q236 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcc4E9Q236 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms