Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srp54bE9PXC0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms