Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
4931408C20RikE9PWP9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4931408C20RikE9PWP9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4931408C20RikE9PWP9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4931408C20RikE9PWP9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4931408C20RikE9PWP9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4931408C20RikE9PWP9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4931408C20RikE9PWP9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4931408C20RikE9PWP9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4931408C20RikE9PWP9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4931408C20RikE9PWP9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4931408C20RikE9PWP9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4931408C20RikE9PWP9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4931408C20RikE9PWP9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4931408C20RikE9PWP9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
4931408C20RikE9PWP9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4931408C20RikE9PWP9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4931408C20RikE9PWP9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4931408C20RikE9PWP9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4931408C20RikE9PWP9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms