Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc17E9PVB5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc17E9PVB5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc17E9PVB5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc17E9PVB5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc17E9PVB5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc17E9PVB5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc17E9PVB5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc17E9PVB5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc17E9PVB5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc17E9PVB5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc17E9PVB5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc17E9PVB5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms