Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim5E9PV98 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim5E9PV98 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim5E9PV98 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim5E9PV98 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim5E9PV98 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim5E9PV98 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim5E9PV98 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim5E9PV98 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim5E9PV98 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim5E9PV98 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim5E9PV98 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim5E9PV98 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim5E9PV98 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim5E9PV98 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim5E9PV98 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim5E9PV98 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim5E9PV98 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim5E9PV98 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms