Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp6ap1lD3Z5W0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms