Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12cD3Z3L3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim12cD3Z3L3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trim12cD3Z3L3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim12cD3Z3L3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim12cD3Z3L3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms