Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
4930467E23RikD3Z1P8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930467E23RikD3Z1P8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms