Protein–RNA interactions for Protein: D3YV89

Mmp27, Matrix metalloproteinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp27D3YV89 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp27D3YV89 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms