Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20547B8JJN0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20547B8JJN0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20547B8JJN0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20547B8JJN0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20547B8JJN0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20547B8JJN0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20547B8JJN0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20547B8JJN0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20547B8JJN0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20547B8JJN0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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