Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pnldc1B2RXZ1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pnldc1B2RXZ1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pnldc1B2RXZ1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pnldc1B2RXZ1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pnldc1B2RXZ1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pnldc1B2RXZ1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pnldc1B2RXZ1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pnldc1B2RXZ1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pnldc1B2RXZ1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pnldc1B2RXZ1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms