Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clrn2B2RVW2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms