Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mbd5B1AYB6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Mbd5B1AYB6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.7 ms