Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prr16A3KMN5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr16A3KMN5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms