Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc9bA3KGF9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms