Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
4931406B18RikA2RSL7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms