Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SktA2AQ25 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SktA2AQ25 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms