Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttll9A2APC3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms