Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GabreA2AMW3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms