Protein–RNA interactions for Protein: A2A6C4

Sppl2c, Signal peptide peptidase-like 2C, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2cA2A6C4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sppl2cA2A6C4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sppl2cA2A6C4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sppl2cA2A6C4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sppl2cA2A6C4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sppl2cA2A6C4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sppl2cA2A6C4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sppl2cA2A6C4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sppl2cA2A6C4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sppl2cA2A6C4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sppl2cA2A6C4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sppl2cA2A6C4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sppl2cA2A6C4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sppl2cA2A6C4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms