Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms