Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hdac5Q9Z2V6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms