Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E4

Ppp1r17, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 17, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppp1r17Q9Z2E4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppp1r17Q9Z2E4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms