Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lgr5Q9Z1P4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms