Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms