Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dctn3Q9Z0Y1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms