Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clip2Q9Z0H8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clip2Q9Z0H8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms